Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK1Q8TDC3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms