Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MGARPQ8TDB4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGARPQ8TDB4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms