Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK9Q8TD19 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK9Q8TD19 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK9Q8TD19 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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