Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGR3Q8TD06 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGR3Q8TD06 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms