Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCW9

PROKR1, Prokineticin receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROKR1Q8TCW9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROKR1Q8TCW9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PROKR1Q8TCW9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROKR1Q8TCW9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms