Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4L1Q8NHW4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL4L1Q8NHW4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL4L1Q8NHW4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms