Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KNL1Q8NG31 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KNL1Q8NG31 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KNL1Q8NG31 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms