Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCPH1Q8NEM0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCPH1Q8NEM0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms