Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEH6

MNS1, Meiosis-specific nuclear structural protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNS1Q8NEH6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MNS1Q8NEH6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MNS1Q8NEH6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MNS1Q8NEH6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MNS1Q8NEH6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MNS1Q8NEH6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MNS1Q8NEH6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MNS1Q8NEH6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MNS1Q8NEH6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MNS1Q8NEH6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MNS1Q8NEH6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MNS1Q8NEH6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms