Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF248Q8NDW4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF248Q8NDW4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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