Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
CARMIL3Q8ND23 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CARMIL3Q8ND23 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL3Q8ND23 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms