Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM35BQ8NCS4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM35BQ8NCS4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms