Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPRYD3Q8NCJ5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPRYD3Q8NCJ5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms