Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ANKRD42Q8N9B4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms