Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Z5

KCTD17, BTB/POZ domain-containing protein KCTD17, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD17Q8N5Z5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCTD17Q8N5Z5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCTD17Q8N5Z5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD17Q8N5Z5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD17Q8N5Z5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD17Q8N5Z5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD17Q8N5Z5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD17Q8N5Z5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD17Q8N5Z5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD17Q8N5Z5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCTD17Q8N5Z5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD17Q8N5Z5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD17Q8N5Z5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD17Q8N5Z5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCTD17Q8N5Z5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms