Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4X5

AFAP1L2, Actin filament-associated protein 1-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFAP1L2Q8N4X5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFAP1L2Q8N4X5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFAP1L2Q8N4X5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFAP1L2Q8N4X5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFAP1L2Q8N4X5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFAP1L2Q8N4X5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFAP1L2Q8N4X5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFAP1L2Q8N4X5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFAP1L2Q8N4X5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFAP1L2Q8N4X5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms