Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4T0

CPA6, Carboxypeptidase A6, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA6Q8N4T0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPA6Q8N4T0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPA6Q8N4T0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPA6Q8N4T0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPA6Q8N4T0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA6Q8N4T0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA6Q8N4T0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms