Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf62Q8N4C0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf62Q8N4C0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms