Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU9

KIRREL3, Kin of IRRE-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3Q8IZU9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIRREL3Q8IZU9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIRREL3Q8IZU9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIRREL3Q8IZU9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIRREL3Q8IZU9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIRREL3Q8IZU9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIRREL3Q8IZU9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIRREL3Q8IZU9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIRREL3Q8IZU9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KIRREL3Q8IZU9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIRREL3Q8IZU9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIRREL3Q8IZU9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1660.1 ms