Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP3Q8IZU3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP3Q8IZU3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP3Q8IZU3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms