Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC170Q8IYT3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC170Q8IYT3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms