Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPAP2Q8IXW5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPAP2Q8IXW5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPAP2Q8IXW5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms