Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUDCD3Q8IVD9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUDCD3Q8IVD9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms