Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9A9Q8IVB4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9A9Q8IVB4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9A9Q8IVB4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms