Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms