Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM50Q86XT4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM50Q86XT4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms