Protein–RNA interactions for Protein: Q86WT6

TRIM69, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM69, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM69Q86WT6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM69Q86WT6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM69Q86WT6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM69Q86WT6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM69Q86WT6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM69Q86WT6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM69Q86WT6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM69Q86WT6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM69Q86WT6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM69Q86WT6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM69Q86WT6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM69Q86WT6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM69Q86WT6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM69Q86WT6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM69Q86WT6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM69Q86WT6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM69Q86WT6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM69Q86WT6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM69Q86WT6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM69Q86WT6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms