Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS2Q86VP3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PACS2Q86VP3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACS2Q86VP3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms