Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALYREFQ86V81 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALYREFQ86V81 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALYREFQ86V81 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALYREFQ86V81 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALYREFQ86V81 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALYREFQ86V81 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ALYREFQ86V81 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALYREFQ86V81 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALYREFQ86V81 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALYREFQ86V81 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALYREFQ86V81 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALYREFQ86V81 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALYREFQ86V81 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALYREFQ86V81 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALYREFQ86V81 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ALYREFQ86V81 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ALYREFQ86V81 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ALYREFQ86V81 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms