Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC6Q7Z403 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms