Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC29A4Q7RTT9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC29A4Q7RTT9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms