Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
HECW1Q76N89 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
HECW1Q76N89 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
HECW1Q76N89 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms