Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDZD4Q76G19 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZD4Q76G19 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZD4Q76G19 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms