Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
H2AFVQ71UI9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFVQ71UI9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms