Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMUB2Q71RG4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMUB2Q71RG4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms