Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYS1Q717R9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYS1Q717R9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYS1Q717R9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158 ms