Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS12Q6ZW61 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BBS12Q6ZW61 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms