Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIAA1549LQ6ZVL6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA1549LQ6ZVL6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA1549LQ6ZVL6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms