Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX8Q6ZV50 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX8Q6ZV50 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms