Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
UBR3Q6ZT12 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBR3Q6ZT12 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms