Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC55Q6ZSA7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC55Q6ZSA7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC55Q6ZSA7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC55Q6ZSA7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC55Q6ZSA7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC55Q6ZSA7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC55Q6ZSA7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC55Q6ZSA7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC55Q6ZSA7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC55Q6ZSA7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC55Q6ZSA7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC55Q6ZSA7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC55Q6ZSA7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC55Q6ZSA7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC55Q6ZSA7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC55Q6ZSA7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms