Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT7Q6ZNI0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT7Q6ZNI0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT7Q6ZNI0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT7Q6ZNI0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT7Q6ZNI0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT7Q6ZNI0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT7Q6ZNI0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT7Q6ZNI0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GCNT7Q6ZNI0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT7Q6ZNI0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms