Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPOCD1Q6ZMY3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms