Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LBX2Q6XYB7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LBX2Q6XYB7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LBX2Q6XYB7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms