Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAP2EQ6VUC0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TFAP2EQ6VUC0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms