Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VSTM1Q6UX27 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VSTM1Q6UX27 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSTM1Q6UX27 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms