Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP8

SBSN, Suprabasin, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSNQ6UWP8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SBSNQ6UWP8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBSNQ6UWP8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SBSNQ6UWP8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms