Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW02

CYP20A1, Cytochrome P450 20A1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP20A1Q6UW02 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP20A1Q6UW02 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CYP20A1Q6UW02 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYP20A1Q6UW02 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms