Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC4A10Q6U841 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC4A10Q6U841 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A10Q6U841 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms