Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CASC1Q6TDU7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CASC1Q6TDU7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASC1Q6TDU7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms